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wiki:documentation:strains

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jliu [Table]
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jliu [Table]
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-===== Backup database =====+===== Backup database ​for transgenic worms ===== 
 + 
 +| Documentation #  ^ Strain Name  ^ (geno) Type                                                                                                     ^ Description ​                                                                                                                                         ^ Location ​      ^ Source ​               ^ Notes                                                                                                                                                              |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 1                | MT17641 ​     | nIs264[gcy-10 prom ::​4xNLS::​gfp,​ lin-15(+)]; lin-15(n765) ​                                                      | I1 marker, backcrossed 3x                                                                                                                            | Box 1, Row 1   | Horvitz (MIT)         | I1, AWC, AWB expression ​                                                                                                                                           |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 2                | MT17912 ​     | nIs282[gcy-10 prom ::​4xNLS::​gfp,​ lin-15(+)]; lin-15(n765) ​                                                      | on Chromosome I, backcrossed 3 times to N2                                                                                                           | Box 1, Row 2   | Horvitz (MIT)         | I1, AWC, AWB expression ​                                                                                                                                           |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 3                | MT21198 ​     | nEx1997[gpa-16 prom ::gfp; unc-54 prom ::rfp] (now gcy-10 is odr-1) ​                                            | ??? paper says gpa-16 promoter but datasheet says gcy-10 ​                                                                                            | Box 1, Row 3   | Horvitz (MIT)         | maintain by picking non-muv ​                                                                                                                                       |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 4                | MT21419 ​     | nIs560[gcy-10 prom ::​enphr3::​yfp;​ lin-15(+)]; lin-15(n765) ​                                                     | YFP in AWC/I1 (faint) ​                                                                                                                               | Box 1, Row 4   | Horvitz (MIT)         | Halorhodopsin in I1                                                                                                                                                |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 5                | MT23561 ​     | nIs552[gcy-10 prom ::​chr2::​yfp;​ lin-15(+)]; lite-1(ce314) gur-3(ok2245) lin-15(n765) ​                           | ChR in I1, AWC, AWB                                                                                                                                  | Box 1, Row 5   | Horvitz (MIT)         | used by Nikhil in paper                                                                                                                                            |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 6                | NL2334 ​      | pkIs1273[gpa-16 prom ::​gfp] ​                                                                                    | GFP in gpa-16 ​                                                                                                                                       | Box 1, Row 6   | Horvitz (MIT)         | super faint GFP in RIP                                                                                                                                             ​| ​  ​| ​  ​| ​  | 
 +| 7                | ZW284        | zwEx104 [inx-4p::​GFP + lin-15(+)] ​                                                                              | GFP in ADA, ADE, AIN, AUA,​\\ ​  AVJ, DVC, FLP, PHA, PHB, PVR, PVT, RIC, RIG, RIM, RIP\\                                                               | Box 1, Row 7   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 8                | BC11358 ​     | pdfr-1::gfp (sIs10334 [rCesC13B9.4::​GFP + pCeh361]) ​                                                            ​| ​                                                                                                                                                     | Box 1, Row 8   | Horvitz (MIT)         ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 9                | AML281 ​      | unc-31 (DA509; AML32) ​                                                                                          ​| ​                                                                                                                                                     | Box 1, Row 9   ​| ​                      | unc on food, whole-brain strain ​                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 10               | AML282 ​      | unc-31 (MT2940; AML32) ​                                                                                         |                                                                                                                                                      | Box 2, Row 1   ​| ​                      | unc on food, whole-brain strain ​                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 11               | PS5647 ​      | unc-119(ed4) III; him-5(e1490) V; syIs202. ​                                                                     |                                                                                                                                                      | Box 2, Row 2   ​| ​                      | syIs202 [vang-1::​YFP + myo-2::​DsRed + unc-119(+)];​ outcrossing suggests array is integrated in LG V. Reference: Green JL, et al. Cell. 2008 Aug 22;​134(4):​646-56. ​ |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 12               | AML283 ​      | wtfIs256 [myo-2::​mCherry] ​                                                                                      | mCherry in Pharynx, outcrossed 6x                                                                                                                    | Box 2, Row 3   ​| ​                      ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 13               | AML284 ​      | wtfIs257 [myo-2::​mCherry] ​                                                                                      | mCherry in Pharynx, outcrossed 6x                                                                                                                    | Box 2, Row 4   ​| ​                      ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 14               | AML327 ​      | pha-1(e2123)III;​ wtfEx275 [j20-ehs-1-"​62bps"::​his-24::​tagBFP::​unc-54 + pBX]                                     | ehs-1 is supposed to be pan-pharyngel neural expression ​                                                                                             | Box 2, Row 5   ​| ​                      | expression only in larvae ​                                                                                                                                         |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 15               | AML328 ​      | pha-1(e2123)III;​ wtfEx276 [j20-ehs-1-"​62bps"::​his-24::​tagBFP::​unc-54 + pBX]                                     | ehs-1 is supposed to be pan-pharyngel neural expression ​                                                                                             | Box 2, Row 6   ​| ​                      | expression only in larvae ​                                                                                                                                         |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 16               | AML32        | wtfIs5 [rab-3p::​NLS::​GCaMP6s + rab-3p::​NLS::​tagRFP]. ​                                                           | Integrated calcium indicator GCaMP6s and calcium-insensitive fluorescent protein RFP in the nuclei of all neurons ​                                   | Box 2, Row 7   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 17               | AML18        | wtfIs3 [rab-3p::​NLS::​GFP + rab-3p::​NLS::​tagRFP]. ​                                                               | RFP and GFP expression in the nuclei of all neurons. AML18 acts as a control for the calcium imaging strain AML14                                    | Box 2, Row 8   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 18               | CZ23281 ​     | juEx7105 [mec-4p::​PH::​miniSOG(Q103L) + mec-4p::​mCherry + ttx-3::​RFP] ​                                           | Pick RFP+ to maintain ​                                                                                                                               | Box 2, Row 9   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 19               | OH15262 ​     | otIs669 V                                                                                                       | NeuroPal ​                                                                                                                                            | Box 3, Row 1   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 20               | OH15265 ​     | otIs672 [rab-3::​NLS::​GCaMP6s + arrd-4:​NLS:::​GCaMP6s] ​                                                           | Bright panneuronal nuclear GCaMP6s expression ​                                                                                                       | Box 3, Row 2   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 21               | OH15500 ​     | otIs669 V; otIs672 ​                                                                                             |                                                                                                                                                      | Box 3, Row 3   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 22               | OH16230 ​     | otIs670 V; otIs672 ​                                                                                             |                                                                                                                                                      | Box 3, Row 4   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 23               | OH16290 ​     | otIs670 V; wtfIs5 ​ [rab-3p::​NLS::​GCaMP6s + rab-3p::​NLS::​tagRFP] ​                                                ​| ​                                                                                                                                                     | Box 3, Row 5   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 24               | SD1614 ​      | ccIs4251 I; stIs10447 ​                                                                                          | ccIs4251 [(pSAK2) myo-3p::​GFP::​LacZ::​NLS + (pSAK4) myo-3p::​mitochondrial GFP + dpy-20(+)] I. stIs10447 [ceh-34p::​HIS-24::​mCherry + unc-119(+)]. ​     | Box 3, Row 6   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 25               | ST2          | ncIs2 [pH20::GFP + pBlueScript] II                                                                              | Expresses GFP in nearly all neurons ​                                                                                                                 | Box 3, Row 7   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 26               | BR5602 ​      | tax-4(p678) III; byEx836 [odr-4p::​tax-4::​GFP + myo-2p::​mCherry] ​                                                ​| ​                                                                                                                                                     | Box 3, Row 8   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 27               | BW1946 ​      | ctIs43 unc-42(e270) V.                                                                                          |                                                                                                                                                      | Box 3, Row 9   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 28               | GRU101 ​      | gnaIs1 [myo-2p::​yfp] ​                                                                                           | Expresses YFP in pharynx ​                                                                                                                            | Box 4, Row 1   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 29               | HA329        | lin-15B&​lin-15A(n765) X; rtEx234 [nlp-13p::​GFP + lin-15(+)] ​                                                    ​| ​                                                                                                                                                     | Box 4, Row 2   | CGC                   | Raise at 20C or higher and pick non-Muv or GFP+ to maintain array. ​                                                                                                ​| ​  ​| ​  ​| ​  | 
 +| 30               | HA341        | lin-15B&​lin-15A(n765) X; rtEx235 [nlp-3p::​GFP + lin-15(+)]. ​                                                    ​| ​                                                                                                                                                     | Box 4, Row 3   | CGC                   | Maintain at 20C or warmer. Pick GFP+ non-Muv to maintain. ​                                                                                                         |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 31               | JN1713 ​      | peIs1713 [sra-6p::​mCasp-1 + unc-122p::​mCherry] ​                                                                 | ASH neurons are eliminated. Abnormal odor chemotaxis ​                                                                                                | Box 4, Row 4   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 32               | JN1715 ​      | peIs1715 [str-1p::​mCasp-1 + unc-122p::​GFP]. ​                                                                    | AWB neurons are eliminated. Abnormal odor chemotaxis ​                                                                                                | Box 4, Row 5   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 33               | LP177        | unc-119(ed3) III; che-12(cp26[GFP + LoxP + unc-119(+) +LoxP]) V.                                                | Entire che-12 coding sequence deleted and replaced with GFP.                                                                                         | Box 4, Row 6   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 34               | LX929  ​      | vsIs48 [unc-17::​GFP]. ​                                                                                          | GFP expressed in all cholinergic neurons. ​                                                                                                           | Box 4, Row 7   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 35               | MH2805  ​     | kuIs70 [alr-1p::​GFP + rol-6(su1006)]. ​                                                                          | Rollers. alr-1p::GFP expression is visible in embryonic and adult tissues. ​                                                                          | Box 4, Row 8   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 36               | MT19454 ​     | nIs396 [sams-5 3'::​4xNLS-GFP + lin-15(+)] V.                                                                    | GFP expression in MI                                                                                                                                 | Box 4, Row 9   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 37               | NH2466  ​     | ayIs4 I;​ dpy-20(e1282) IV.                                                                                      ​| ​                                                                                                                                                     | Box 5, Row 1   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 38               | NY2045 ​      | ynIs45 [flp-15p::​GFP] I; him-5(e1490) V.                                                                        |                                                                                                                                                      | Box 5, Row 2   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 39               | NY2049 ​      | ynIs49 [flp-5p::​GFP]. ​                                                                                          ​| ​                                                                                                                                                     | Box 5, Row 3   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 40               | NY2064  ​     | ynIs64 [flp-17p::​GFP] I; him-5(e1490) V.                                                                        |                                                                                                                                                      | Box 5, Row 4   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 41               | OH14372 ​     | pha-1(e2123) III; him-5(e1490) V; otEx6713 [str-97p::​GFP + pha-1(+)]. ​                                          ​| ​                                                                                                                                                     | Box 5, Row 5   | CGC                   | Maintain at 25C to select for transgenic array.  ​                                                                                                                  ​| ​  ​| ​  ​| ​  | 
 +| 42               | PS3504  ​     | syIs54 [ceh-2::GFP + unc-119(+)];​ unc-119(ed4) III.                                                             ​| ​                                                                                                                                                     | Box 5, Row 6   | CGC                   | Do not distribute this strain; other labs should request it from the CGC                                                                                           ​| ​  ​| ​  ​| ​  | 
 +| 43               | PY2417 ​      | oyIs44 [odr-1::RFP + lin-15(+)]. ​                                                                               | Bright RFP in AWB and AWC.                                                                                                                           | Box 5, Row 7   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 44               | VM123        | lin-15B&​lin-15A(n765) X; akEx29 [glr-8::GFP + lin-15(+)]. ​                                                      ​| ​                                                                                                                                                     | Box 5, Row 8   | CGC                   | Maintain by picking non-Muv. Worms with the array are non-Muv at 20C.                                                                                              |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 45               | VM149        | lin-15B&​lin-15A(n765) X; akEx38 [(pDM46) glr-7::GFP + (pJM23) lin-15(+)] ​                                       |                                                                                                                                                      | Box 5, Row 9   | CGC                   | Worms with the array are non-Muv at 20C.                                                                                                                           ​| ​  ​| ​  ​| ​  | 
 +| 46               | IC1204 ​      | mIs10; him-8                                                                                                    | bright GFP in pharynx ​                                                                                                                               | Box 6, Row 1   | Ian Chin-Sang gift    |                                                                                                                                                                    |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 47               | IC722        | mIs11; him-5                                                                                                    | bright GFP in pharynx ​                                                                                                                               | Box 6, Row 2   | Ian Chin-Sang gift    |                                                                                                                                                                    |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 48               | IC314        | zdIs5; him-5                                                                                                    | GFP in 6 touch neurons ​                                                                                                                              | Box 6, Row 3   | Ian Chin-Sang gift    |                                                                                                                                                                    |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 49               | INF49        | spp-12p::​gfp;​ rol-6 as coinjection marker ​                                                                      | GFP in NSM and I6, roller worms. ​                                                                                                                    | Box 6, Row 4   | Matthias Leippe ​      ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 50               | ZX1917 ​      | zxEx942[pmyo2::​QuasAr::​mOrange;​ pmyo-3::​CFP] ​                                                                   |                                                                                                                                                      | Box 6, Row 5   | Alexander Gottschalk ​ |                                                                                                                                                                    |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 51               | ZX1918 ​      | zxEx943[pmyo-2::​MacQ::​mCitrine;​ pmyo3::​mCherry] ​                                                                ​| ​                                                                                                                                                     | Box 6, Row 6   | Alexander Gottschalk ​ |                                                                                                                                                                    |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 52               | ZX1958 ​      | zxEx944[pmyo-2::​ArchD95N::​2xmyc-tag;​ pmyo3::​CFP] ​                                                               |                                                                                                                                                      | Box 6, Row 7   | Alexander Gottschalk ​ |                                                                                                                                                                    |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 53               | OK0765 ​      | cuEx613[dbl-1 M4 enhancerwild-type] ​                                                                            | Label M4 neuron, GFP                                                                                                                                 | Box 6, Row 8   | Peter Okkema ​         | Pick rollers ​                                                                                                                                                      ​| ​  ​| ​  ​| ​  | 
 +| 54               | LSC1428 ​     | trh-1(lst1118);​ lstEx776 [Pglr-8::​trh-1::​SL2::​gfp,​ 50 ng/μL + pCIM02 (Punc-122::​dsRED),​ 50 ng/​μL]. ​             | Label M4 and M5 neurons ​                                                                                                                             | Box 6, Row 9   | Isabel Beets          | Pick GFP or RFP worms                                                                                                                                              |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 55               | MT15670 ​     | nIs175 IV  [ceh-28p::​4xNLS::​GFP + lin-15(+)] ​                                                                   | M4 marker ​                                                                                                                                           | Box 7, Row 1   | Bob Horvitz ​          | Backcrossed 5 times                                                                                                                                                |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 56               | MT15672 ​     | nIs177 I [ceh-28p::​4NLS::​GFP + lin-15(+)]. ​                                                                     | M4 marker ​                                                                                                                                           | Box 7, Row 2   | Bob Horvitz ​          | Backcrossed 5 times                                                                                                                                                |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 57               | MT17913 ​     | nIs283 X [gcy-10p::​GFP + lin-15(+)] ​                                                                            | I1 marker ​                                                                                                                                           | Box 7, Row 3   | Bob Horvitz ​          | Backcrossed 3 times                                                                                                                                                |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 58               | MT19378 ​     | nIs390 III [Pflp-15∷gfp,​ lin-15AB(+)] ​                                                                          | I2 marker ​                                                                                                                                           | Box 7, Row 4   | Bob Horvitz ​          | Backcrossed 5 times                                                                                                                                                |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 59               | MT21910 ​     | lin-15AB(n765ts) X; nEx2065 [Pgur-3::​gfp,​ lin-15(+)] ​                                                           | Expressed in I2, I4, AVD and PVC                                                                                                                     | Box 7, Row 5   | Bob Horvitz ​          ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 60               | INF100 ​      | tax-2(p671);​ gnaIs1 [myo-2p::​yfp] ​                                                                              ​| ​                                                                                                                                                     | Box 7, Row 6   | Nicolina ​             |                                                                                                                                                                    |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 61               | IC765        | quEx180 [rde-1p::​rfp] ​                                                                                          | pick RFP to maintain ​                                                                                                                                | Box 7, Row 7   | Ian Chin-Sang ​        ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 62               | IC2226 ​      | quIs29 ​                                                                                                         | integrated rde-1p::rfp with rgef-1p::​ins-4 ​                                                                                                          | Box 7, Row 8   | Ian Chin-Sang ​        ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 63               | INF101 ​      | tax-4(ok3113)III;​ gnaIsl[myo2-p::​yfp] ​                                                                          | YFP in pharynx, defective chemotaxis ​                                                                                                                | Box 7, Row 9   | Nicolina ​             |                                                                                                                                                                    |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 64               | INF102 ​      | unc-9(e101)X;​ gnaIsl[myo2-p::​yfp] ​                                                                              | YFP in pharynx, unc                                                                                                                                  | Box 8, Row 1   | Nicolina ​             |                                                                                                                                                                    |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 65               | INF103 ​      | pkc-1(nj1)V;​ gnaIsl[myo2-p::​yfp] ​                                                                               | YFP in pharynx, defective chemotaxis to AWA- and AWC- odorants ​                                                                                      | Box 8, Row 2   | Nicolina ​             |                                                                                                                                                                    |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 66               | INF104 ​      | pels1715[str-1p::​mCasp-1 + unc-122p::​GFP];​ gnasIsl[myo2-p::​yfp] ​                                                | YFP in pharynx, GFP spots on underside, AWB eliminated ​                                                                                              | Box 8, Row 3   | Nicolina ​             |                                                                                                                                                                    |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 67               | SWF62        | flvEx30[Ptph-1::​GCaMP5a,​ Ptph-1::​mCherry,​ Psrg-47:: GCaMP5a, Psrg-47::​mCherry] ​                                  ​| ​                                                                                                                                                     | Box 8, Row 4   | Steven Flavell ​       |                                                                                                                                                                    |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 68               | CX15388 ​     | kyEx5178[tph-1(short)::​HisCl1-sl2-mCherry] ​                                                                     |                                                                                                                                                      | Box 8, Row 5   | Steven Flavell ​       |                                                                                                                                                                    |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 69               | CX15485 ​     | unc-13(s69);​ lite-1(ce314);​ kyEx4656 [tph-1-NSMfragment::​GCaMP5A;​ myo-3::​mCherry] ​                              ​| ​                                                                                                                                                     | Box 8, Row 6   | Steven Flavell ​       |                                                                                                                                                                    |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 70               | CX16651 ​     | kyIs694 [tph-1-NSM-fragment::​rpl-22-3xHA;​ tph-1NSM-fragment::​GFP] ​                                              ​| ​                                                                                                                                                     | Box 8, Row 7   | Steven Flavell ​       |                                                                                                                                                                    |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 71               | CZ20310 ​     | juSi164 unc-119(ed3) III.                                                                                       | optogenetic strain for integration and mutagenesis ​                                                                                                  | Box 8, Row 8   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 72               | OH15363 ​     | otIs669 him-5(e1490) V                                                                                          | NeuroPal with him-5                                                                                                                                  | Box 8, Row 9   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 73               | OH4141 ​      | zdIs21 IV; wrk-1(ok695) X                                                                                       ​| ​                                                                                                                                                     | Box 9, Row 1   | CGC                   ​| ​                                                                                                                                                                   |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 74               | PS6843 ​      | syIs300 [15xUAS::?​pes-10::​GFP::​unc-54 3'UTR + ttx-3p::RFP + pBlueScript].  V                                    | GFP cGAL effector.  Some worms do not express ttx-3p::​RFP marker,​ but will consistently produce worms with transgenetic marker in next generation.  ​ | Box 9, Row 2   | CGC                   | Backcrossed 7 times                                                                                                                                                |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 75               | PS6844 ​      | syIs301 [myo-2p:​NLS::​GAL4SC::​VP64::​unc-54 3'UTR + unc-122p::​RFP + 1kb DNA ladder (NEB)] V.                      | myo-2 cGAL driver for pharyngeal muscle. ​                                                                                                            | Box 9, Row 3   | CGC                   | Backcrossed 5 times                                                                                                                                                |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 76               | PS6872 ​      | syIs302 [15xUAS::?​pes-10::​GFP::​unc-54 3'UTR + ttx-3p::RFP + pBlueScript]. III.                                  | GFP cGAL effector.  ​                                                                                                                                 | Box 9, Row 4   | CGC                   | Backcrossed 6 times                                                                                                                                                |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 77               | PS6963 ​      | syIs336 [rab-3p::​NLS::​GAL4SK::​VP64::​let-858 3'UTR + unc-122p::​RFP +  pBlueScript]. X.                           | rab-3 cGAL driver for the whole nervous system.  ​                                                                                                    | Box 9, Row 5   | CGC                   | Backcrossed 4 times                                                                                                                                                |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 78               | PS7185 ​      | syIs406 [15xUAS::?​pes-10::​GFP::​H2B::​let-858 3'UTR + ttx-3p::RFP + pBlueScript]. ​ IV.                            | GFP::H2B effector.  Very weak background fluorescence in first ring of intestinal cells and posterior intestinal cells.  ​                            | Box 9, Row 6   | CGC                   | Backcrossed 3 times                                                                                                                                                |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 79               | PS7190 ​      | syIs409 [15xUAS::?​pes-10::​mCherry::​H2B::​let-858 3'UTR + unc-122p::​GFP + pBlueScript] X.                         | mCherry::​H2B cGAL effector.  Very weak background fluorescence in first ring of intestinal cells and posterior intestinal cells. ​                    | Box 9, Row 7   | CGC                   | Backcrossed 2 times                                                                                                                                                |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 80               | PS7199 ​      | syIs371 [15xUAS::?​pes-10::​HisCl1::​SL2::​GFP::​let-858 3'UTR + unc-122p::​GFP + 1kb DNA ladder(NEB)] III.           | Histamine chloride channel cGAL effector. ​                                                                                                           | Box 9, Row 8   | CGC                   | Backcrossed 3 times                                                                                                                                                |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 81               | PS7200 ​      | syIs420 [15xUAS::?​pes-10::​tetx::​let-858 3'UTR + myo-2p::​NLS::​GFP + pBlueScript] IV.                             | Tetanus toxin cGAL effector. ​                                                                                                                        | Box 9, Row 9   | CGC                   | Backcrossed 3 times                                                                                                                                                |   ​| ​  ​| ​  | 
 +| 82               | PS7203 ​      | syIs423 [15xUAS::?​pes-10::​GCaMP6s::​SL2::​mKate2::​let-858 3'UTR + myo-2p::​NLS::​mCherry + 1kb DNA ladder(NEB)] V.  | GCaMP6s cGAL effector. ​                                                                                                                              | Box 10, Row 1  | CGC                   | Backcrossed 3 times                                                                                                                                                |   ​| ​  ​| ​  | 
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 +===== Backup mutant database (ie. non-transgenics) ===== 
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 +| Numbering #  ^ Strain Name     ^ (geno) Type                        ^ Description ​ ^ Location ​      ^ Source ​                  ^ Notes       ^ 
 +| NT1          | CB4856 ​         | Hawaiian isolate of C. elegans ​    ​| ​             | Box 10, Row 1  | Grosshans (FMI), HW2675 ​ |             | 
 +| NT2          | N2              | wt                                 ​| ​             | Box 10, Row 2  | Grosshans (FMI)          |             | 
 +| NT3          | HW2678 ​         | eat-2(ad1116) ​                     |              | Box 10, Row 3  | Grosshans (FMI)          |             | 
 +| NT4          | HW2679 ​         | eat-2(ad1113) ​                     |              | Box 10, Row 4  | Grosshans (FMI)          |             | 
 +| NT5          | CB101           | unc-9(e101) X                      |              | Box 10, Row 5  | CGC                      |             | 
 +| NT6          | CB187           | rol-6(e187) II                     ​| ​             | Box 10, Row 6  | CGC                      |             | 
 +| NT7          | CB1128 ​         | che-7(e1128) V                     ​| ​             | Box 10, Row 7  | CGC                      |             | 
 +| NT8          | DA509           | unc-31(e928) IV                    |              | Box 10, Row 8  | CGC                      |             | 
 +| NT9          | MT2940 ​         | unc-31(n1304) IV                   ​| ​             | Box 10, Row 9  | CGC                      |             | 
 +| NT10         | MT6308 ​         | eat-4(ky5) III                     ​| ​             | Box 11, Row 1  | CGC                      |             | 
 +| NT11         | TQ1101 ​         | lite-1(xu7) X                      |              | Box 11, Row 2  | CGC                      |             | 
 +| NT12         | BR5514  ​        | tax-2(p671) I; tax-4(p678) III     ​| ​             | Box 11, Row 3  | CGC                      | 23-12-2019 ​ | 
 +| NT13         | IK105           | pkc-1(nj1) V.                      |              | Box 11, Row 4  | CGC                      | 23-12-2019 ​ | 
 +| NT14         | MT5300 ​         | odr-4(n2144) III.                  |              | Box 11, Row 5  | CGC                      | 23-12-2019 ​ | 
 +| NT15         | N2              | C. elegans wild isolate. ​          ​| ​             | Box 11, Row 6  | CGC                      | 23-12-2019 ​ | 
 +| NT16         | N2 (ancestral) ​ | C. elegans wild type (ancestral). ​ |              | Box 11, Row 7  | CGC                      | 23-12-2019 ​ | 
 +| NT17         | PR671  ​         | tax-2(p671) I.                     ​| ​             | Box 11, Row 8  | CGC                      | 23-12-2019 ​ | 
 +| NT18         | PR678           | tax-4(p678) III.                   ​| ​             | Box 11, Row 9  | CGC                      | 23-12-2019 ​ | 
 +| NT19         | PR691           | tax-2(p691) I.                     ​| ​             | Box 12, Row 1  | CGC                      | 23-12-2019 ​ | 
 +| NT20         | VC3113 ​         | tax-4(ok3771) III.                 ​| ​             | Box 12, Row 2  | CGC                      | 23-12-2019 ​ | 
 +| NT21         | WM27            | rde-1(ne219) V                     ​| ​             | Box 12, Row 3  | Ian Chin-Sang ​           |             | 
 +| NT22         | CB5             | unc-7(e5) X.                       ​| ​             | Box 12, Row 4  | CGC                      |             | 
 +|              |                 ​| ​                                   |              |                |                          |             | 
 +|              |                 ​| ​                                   |              |                |                          |             | 
 +|              |                 ​| ​                                   |              |                |                          |             | 
 +|              |                 ​| ​                                   |              |                |                          |             | 
 +|              |                 ​| ​                                   |              |                |                          |             | 
 +|              |                 ​| ​                                   |              |                |                          |             | 
 +|              |                 ​| ​                                   |              |                |                          |             | 
 +|              |                 ​| ​                                   |              |                |                          |             | 
 +|              |                 ​| ​                                   |              |                |                          |             | 
 +|              |                 ​| ​                                   |              |                |                          |             | 
 +|              |                 ​| ​                                   |              |                |                          |             | 
 +|              |                 ​| ​                                   |              |                |                          |             | 
 +|              |                 ​| ​                                   |              |                |                          |             | 
 +|              |                 ​| ​                                   |              |                |                          |             | 
 +|              |                 ​| ​                                   |              |                |                          |             | 
 +|              |                 ​| ​                                   |              |                |                          |             | 
 +|              |                 ​| ​                                   |              |                |                          |             |
  
-| Documentation #  ^ Strain Name  ^ (geno) Type                                                                           ^ Description ​                                                                                                       ^ Location ​ ^ Source ​                  ^ Notes                                                                                                                                                              ^ 
-| -1               | CB4856 ​      | Hawaiian isolate of C. elegans ​                                                       |                                                                                                                    |           | Grosshans (FMI), HW2675 ​ |                                                                                                                                                                    | 
-| 0                | N2           | wt                                                                                    |                                                                                                                    |           | Grosshans (FMI)          |                                                                                                                                                                    | 
-| 1                | MT17641 ​     | nIs264[gcy-10 prom ::​4xNLS::​gfp,​ lin-15(+)]; lin-15(n765) ​                            | I1 marker, backcrossed 3x                                                                                          |           | Horvitz (MIT)            | I1, AWC, AWB expression ​                                                                                                                                           | 
-| 2                | MT17912 ​     | nIs282[gcy-10 prom ::​4xNLS::​gfp,​ lin-15(+)]; lin-15(n765) ​                            | on Chromosome I, backcrossed 3 times to N2                                                                         ​| ​          | Horvitz (MIT)            | I1, AWC, AWB expression ​                                                                                                                                           | 
-| 3                | MT21198 ​     | nEx1997[gpa-16 prom ::gfp; unc-54 prom ::rfp] (now gcy-10 is odr-1) ​                  | ??? paper says gpa-16 promoter but datasheet says gcy-10 ​                                                          ​| ​          | Horvitz (MIT)            | maintain by picking non-muv ​                                                                                                                                       | 
-| 4                | MT21419 ​     | nIs560[gcy-10 prom ::​enphr3::​yfp;​ lin-15(+)]; lin-15(n765) ​                           | YFP in AWC/I1 (faint) ​                                                                                             |           | Horvitz (MIT)            | Halorhodopsin in I1                                                                                                                                                | 
-| 5                | MT23561 ​     | nIs552[gcy-10 prom ::​chr2::​yfp;​ lin-15(+)]; lite-1(ce314) gur-3(ok2245) lin-15(n765) ​ | ChR in I1, AWC, AWB                                                                                                |           | Horvitz (MIT)            | used by Nikhil in paper                                                                                                                                            | 
-| 6                | NL2334 ​      | pkIs1273[gpa-16 prom ::​gfp] ​                                                          | GFP in gpa-16 ​                                                                                                     |           | Horvitz (MIT)            | super faint GFP in RIP                                                                                                                                             | 
-| 7                | ZW284        | zwEx104 [inx-4p::​GFP + lin-15(+)] ​                                                    | GFP in ADA, ADE, AIN, AUA,​\\ ​  AVJ, DVC, FLP, PHA, PHB, PVR, PVT, RIC, RIG, RIM, RIP\\                             ​| ​          | CGC                      |                                                                                                                                                                    | 
-| 8                | BC11358 ​     | pdfr-1::gfp (sIs10334 [rCesC13B9.4::​GFP + pCeh361]) ​                                  ​| ​                                                                                                                   |           | Horvitz (MIT)            |                                                                                                                                                                    | 
-| 9                | AML281 ​      | unc-31 (DA509; AML32) ​                                                                ​| ​                                                                                                                   |           ​| ​                         | unc on food, whole-brain strain ​                                                                                                                                   | 
-| 10               | AML282 ​      | unc-31 (MT2940; AML32) ​                                                               |                                                                                                                    |           ​| ​                         | unc on food, whole-brain strain ​                                                                                                                                   | 
-| 11               | PS5647 ​      | unc-119(ed4) III; him-5(e1490) V; syIs202. ​                                           |                                                                                                                    |           ​| ​                         | syIs202 [vang-1::​YFP + myo-2::​DsRed + unc-119(+)];​ outcrossing suggests array is integrated in LG V. Reference: Green JL, et al. Cell. 2008 Aug 22;​134(4):​646-56. ​ | 
-| 12               | AML283 ​      | wtfIs256 [myo-2::​mCherry] ​                                                            | mCherry in Pharynx, outcrossed 6x                                                                                  |           ​| ​                         |                                                                                                                                                                    | 
-| 13               | AML284 ​      | wtfIs257 [myo-2::​mCherry] ​                                                            | mCherry in Pharynx, outcrossed 6x                                                                                  |           ​| ​                         |                                                                                                                                                                    | 
-| 14               | AML327 ​      | pha-1(e2123)III;​ wtfEx275 [j20-ehs-1-"​62bps"::​his-24::​tagBFP::​unc-54 + pBX]           | ehs-1 is supposed to be pan-pharyngel neural expression ​                                                           |           ​| ​                         | expression only in larvae ​                                                                                                                                         | 
-| 15               | AML328 ​      | pha-1(e2123)III;​ wtfEx276 [j20-ehs-1-"​62bps"::​his-24::​tagBFP::​unc-54 + pBX]           | ehs-1 is supposed to be pan-pharyngel neural expression ​                                                           |           ​| ​                         | expression only in larvae ​                                                                                                                                         | 
-| 16               | HW2678 ​      | eat-2(ad1116) ​                                                                        ​| ​                                                                                                                   |           | Grosshans (FMI)          | Benjamin Towbin obtained from the Ciosk Lab and backcrossed twice                                                                                                  | 
-| 17               | HW2679 ​      | eat-2(ad1113) ​                                                                        ​| ​                                                                                                                   |           | Grosshans (FMI)          | Benjamin Towbin obtained from the Ciosk Lab and backcrossed twice                                                                                                  | 
-| 18               | AML32        | wtfIs5 [rab-3p::​NLS::​GCaMP6s + rab-3p::​NLS::​tagRFP]. ​                                 | Integrated calcium indicator GCaMP6s and calcium-insensitive fluorescent protein RFP in the nuclei of all neurons ​ |           | CGC                      |                                                                                                                                                                    | 
-| 19               | AML18        | wtfIs3 [rab-3p::​NLS::​GFP + rab-3p::​NLS::​tagRFP]. ​                                     | RFP and GFP expression in the nuclei of all neurons. AML18 acts as a control for the calcium imaging strain AML14  |           | CGC                      |                                                                                                                                                                    | 
-| 20               | CB101        | unc-9(e101) X                                                                         ​| ​                                                                                                                   |           | CGC                      |                                                                                                                                                                    | 
-| 21               | CB187        | rol-6(e187) II                                                                        |                                                                                                                    |           | CGC                      |                                                                                                                                                                    | 
-| 22               | CB1128 ​      | che-7(e1128) V                                                                        |                                                                                                                    |           | CGC                      |                                                                                                                                                                    | 
-| 23               | CZ23281 ​     | juEx7105 [mec-4p::​PH::​miniSOG(Q103L) + mec-4p::​mCherry + ttx-3::​RFP] ​                 | Pick RFP+ to maintain ​                                                                                             |           | CGC                      |                                                                                                                                                                    | 
-| 24               | DA509        | unc-31(e928) IV                                                                       ​| ​                                                                                                                   |           | CGC                      |                                                                                                                                                                    | 
-| 25               | MT2940 ​      | unc-31(n1304) IV                                                                      |                                                                                                                    |           | CGC                      |                                                                                                                                                                    | 
-| 26               | MT6308 ​      | eat-4(ky5) III                                                                        |                                                                                                                    |           | CGC                      |                                                                                                                                                                    | 
-| 27               | OH15262 ​     | otIs669 V                                                                             ​| ​                                                                                                                   |           | CGC                      |                                                                                                                                                                    | 
-| 28               | OH15265 ​     | otIs672 ​                                                                              ​| ​                                                                                                                   |           | CGC                      |                                                                                                                                                                    | 
-| 29               | OH15500 ​     | otIs669 V; otIs672 ​                                                                   |                                                                                                                    |           | CGC                      |                                                                                                                                                                    | 
-| 30               | OH16230 ​     | otIs670 V; otIs672 ​                                                                   |                                                                                                                    |           | CGC                      |                                                                                                                                                                    | 
-| 31               | OH16290 ​     | otIs670 V; wtIs5                                                                      |                                                                                                                    |           | CGC                      |                                                                                                                                                                    | 
-| 32               | SD1614 ​      | ccIs4251 I; stIs10447 ​                                                                ​| ​                                                                                                                   |           | CGC                      |                                                                                                                                                                    | 
-| 33               | ST2          | ncIs2 [pH20::GFP + pBlueScript] II                                                    | Expresses GFP in nearly all neurons ​                                                                               |           | CGC                      |                                                                                                                                                                    | 
-| 34               | TQ1101 ​      | lite-1(xu7) X                                                                         ​| ​                                                                                                                   |           | CGC                      |                                                                                                                                                                    | 
-|                  |              |                                                                                       ​| ​                                                                                                                   |           ​| ​                         |                                                                                                                                                                    | 
-|                  |              |                                                                                       ​| ​                                                                                                                   |           ​| ​                         |                                                                                                                                                                    | 
-|                  |              |                                                                                       ​| ​                                                                                                                   |           ​| ​                         |                                                                                                                                                                    | 
-|                  |              |                                                                                       ​| ​                                                                                                                   |           ​| ​                         |                                                                                                                                                                    | 
-|                  |              |                                                                                       ​| ​                                                                                                                   |           ​| ​                         |                                                                                                                                                                    | 
  
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