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mscholz [General C. elegans maintenance]
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mscholz [Table]
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 ==== Introductory reading for our lab  ==== ==== Introductory reading for our lab  ====
  
-**About //Celegans//​** +These papers are an ideal startPowerpoint presentations can be found on our dropbox.
-^  1  ^  Paper                                                                           ​^ ​ Presenter ​ ^  Time  ^  Date  ^  Topic                                                                                                               ^ +
-|     ​| ​ **Introduction to our lab and lab safety** ​                                     |  Monika ​    ​| ​ 1h    | 8/11   ​| ​ [[https://​docs.google.com/​presentation/​d/​1WrWuTGTLtWefrR9Ti_WGQHvbf2DlQbYxFi6UNzp-WtQ/​edit?​usp=sharing| Overview]] ​ | +
-|     ​| ​ http://​www.wormbook.org/​chapters/​www_celegansintro/​celegansintro.html ​          ​| ​ Jun        |  20    | 12/11  |  Nomenclature ​                                                                                                       | +
-|     ​| ​ http://​www.wormbook.org/​chapters/​www_feeding/​feeding.html ​                      ​| ​ Nicolina ​  ​| ​ 20    | 12/11  |  Behavior ​                                                                                                           | +
-|     ​| ​ https://​journals.plos.org/​ploscompbiol/​article?​id=10.1371/​journal.pcbi.1000028 ​ |  Luis       ​| ​ 20    | 15/11  |  Behavior quantification ​                                                                                            | +
-^  2  ^                                                                                  ^             ​^ ​       ^        ^                                                                                                                      ^ +
-|     ​| ​ **Neurobiology of C. elegans** ​                                                 |  Monika ​    ​| ​ 20    | 15/11  |                                                                                                                      | +
-|     ​| ​ https://​www.biorxiv.org/​content/​10.1101/​676312v1 ​                               |  Jun        |  20    | 19/11  |  labelling neurons ​                                                                                                  | +
-|     ​| ​ https://​www.pnas.org/​content/​113/​8/​E1074 ​                                       |  Nicolina ​  ​| ​ 20    | 22/11  |  calcium imaging ​                                                                                                    | +
-|     ​| ​ https://​www.nature.com/​articles/​s41586-019-1352-7 ​                              ​| ​ Luis       ​| ​ 20    | 26/11  |  connectome ​                                                                                                         | +
-^  3  ^                                                                                  ^             ​^ ​       ^        ^                                                                                                                      ^ +
-|     ​| ​ **Measuring the different behaviors of C. elegans** ​                            ​| ​ Monika ​    ​| ​ 1h    | 29/11  |  behavior ​                                                                                                           | +
-|     ​| ​ https://​www.sciencedirect.com/​science/​article/​pii/​S096098221930925X ​            ​| ​ Jun        |  20    | 3/12   ​| ​ foraging ​                                                                                                           | +
-|     ​| ​ https://​www.nature.com/​articles/​ncomms14221 ​                                    ​| ​ Nicolina ​  ​| ​ 20    | 6/12   ​| ​ pumping ​                                                                                                            | +
-|     ​| ​ https://​www.biorxiv.org/​content/​10.1101/​791764v1 ​                               |  Luis       ​| ​ 20    | 10/12  |  sleep                                                                                                               | +
-^  4  ^  **Crazy and surprising results** ​                                               ^             ​^ ​       ^        ^                                                                                                                      ^ +
-|     ​| ​ https://​www.biorxiv.org/​content/​10.1101/​092072v2 ​                               |  Jun        |  20    | 17/12  |  color discrimination ​                                                                                               | +
-|     ​| ​ https://​jeb.biologists.org/​content/​209/​1/​89.short ​                              ​| ​ Nicolina ​  ​| ​ 20    | 17/12  |  taste                                                                                                               | +
-|     ​| ​ https://​www.nature.com/​articles/​s41467-019-11163-3 ​                             |  Luis       ​| ​ 20    | 17/12  |  irrational choices ​                                                                                                 | +
-^  5  ^  **Methods week** ​                                                               ^             ​^ ​       ^        ^                                                                                                                      ^ +
-|     ​| ​ Introduction to SCAPE and lightsheet microscopy ​                                ​| ​ Luis       ​| ​ 30    |        |  technique ​                                                                                                          | +
-|     ​| ​ Kato et al., 2015                                                               ​| ​ Monika ​    ​| ​ 30    |        |  wholebrain imaging ​                                                                                                 | +
-|     ​| ​ https://​bmcbiol.biomedcentral.com/​articles/​10.1186/​s12915-016-0232-y ​           |  Nicolina ​  ​| ​ 30    |        |  foraging ​                                                                                                           | +
-|     ​| ​ https://​www.sciencedirect.com/​science/​article/​pii/​S0092867418315150 ​            ​| ​ Jun        |  30    |        |  sensing food                                                                                                        |+
  
 +
 +[[wiki:​join:​read:​firstpapers|Recommended reading]]
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 +**Reading Spring 2020**
 +^  1  ^  Paper                                                                                 ​^ ​ Presenter ​ ^  Time  ^  Date      ^  Topic                                       ^
 +|     | https://​www.nature.com/​articles/​s41467-019-13008-5 ​                                    ​| ​            ​| ​       |            | sleep in microfluidics ​                      |
 +|     | https://​www.genetics.org/​content/​212/​1/​25.abstract ​                                    ​| ​            ​| ​       |            | review sensory pathways ​                     |
 +|     | https://​www.ncbi.nlm.nih.gov/​pmc/​articles/​PMC4982933/ ​                                 | Luis        |        | 3/​3/​2020 ​  | durotaxis in C. elegans ​                     |
 +|     | https://​www.biorxiv.org/​content/​10.1101/​759928v1 ​                                      | Jun         ​| ​       | 10/​3/​2020 ​ | collective feeding ​                          |
 +^  2  ^ Encoding and models ​                                                                   ^             ​^ ​       ^            ^                                              ^
 +|     | https://​www.biorxiv.org/​content/​biorxiv/​early/​2020/​01/​25/​2020.01.24.918169.full.pdf ​   | Luis        |        |            | decision models ​                             |
 +|     | https://​journals.plos.org/​plosgenetics/​article?​id=10.1371/​journal.pgen.1007134#​sec002 ​ |             ​| ​       |            | pumping inhibiton through I1                 |
 +|     | https://​www.sciencedirect.com/​science/​article/​pii/​S0960982219303872#​fig6 ​              | Jun         ​| ​       |            | memory in two neurons ​                       |
 +|     | https://​www.sciencedirect.com/​science/​article/​pii/​S2589004219302536#​fig1 ​              | Nicolina ​   |        |            | neurons in noisy enviornment ​                |
 +^  3  ^ Serotonin ​                                                                             ^             ​^ ​       ^            ^                                              ^
 +|     | https://​www.sciencedirect.com/​science/​article/​pii/​S0168010219300768#​fig0010 ​           | Nicolina ​   |        | 31/​3/​2020 ​ | review 5-HT in feeding ​                      |
 +|     | https://​link.springer.com/​article/​10.1007/​s00424-018-2202-4 ​                           | Nicolina ​   |        |            | serotonin alters sensory neurons ​            |
 +|     | https://​www.biorxiv.org/​content/​10.1101/​2020.02.04.934547v1.full.pdf ​                  ​| ​            ​| ​       |            | persistent behavior through neuromodulation ​ |
 +|     ​| ​                                                                                       |             ​| ​       |            |                                              |
 +^  4  ^                                                                                        ^             ​^ ​       ^            ^                                              ^
 +|     ​| ​                                                                                       |             ​| ​       |            |                                              |
 +|     ​| ​                                                                                       |             ​| ​       |            |                                              |
 +|     ​| ​                                                                                       |             ​| ​       |            |                                              |
 +^  5  ^                                                                                        ^             ​^ ​       ^            ^                                              ^
 +|     ​| ​                                                                                       |             ​| ​       |            |                                              |
 +|     ​| ​                                                                                       |             ​| ​       |            |                                              |
 +|     ​| ​                                                                                       |             ​| ​       |            |                                              |
 +|     ​| ​                                                                                       |             ​| ​       |            |                                              |
  
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wiki/join/read.1574838859.txt.gz · Last modified: 2019/11/27 08:14 by mscholz

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